A linha 2006 da minivan Zafira chega ao mercado com poucas novidades.

O novo modelo conta com novas cores. São elas: prata Polaris e cinza Argos, ambas metálicas e azul Posidon, perolizada.  As versões não mudam. Permanecem a versão de entrada Comfort, a intermediária Elegance e a topo Elite, que ganhou um novo porta-objetos, na forma de uma gaveta sob o banco dianteiro do passageiro.

Outra novidade é o motor. A Zafira 2006 agora possui apenas o propulsor 2,0 bicombustível, que rende 121 cavalos e 18,3 m.kgf de torque com gasolina e 127,6 cv e 19,6 m.kgf com álcool. O modelo recebeu também o sistema de acelerador eletrônico (drive by wire).

Ainda, a Zafira 2006 com álcool, acelera de 0 a 100 km/h em 11,4 segundos e atinge a velocidade máxima de 188 km/h. Utilizando apenas gasolina, a aceleração de 0 a 100 km/h ocorre em 12 segundos e a máxima limitada eletronicamente é de 183 km/h.